ความไม่พอใจของพระสงฆ์กลุ่มหนึ่งที่มีต่อ ผอ.สำนักงานพระพุทธฯ ดูเหมือนจะค่อยๆก่อตัวขึ้น นับตั้งแต่การตรวจสอบทุจริตเงินอุดหนุนวัด นำไปสู่การตัดความสัมพันธ์กับผู้อำนวยการ และไม่ขอรับเงินอุดหนุน โดยมองว่า บทบาทของ ผอ.สำนักพุทธ ทำให้ศาสนาเสื่อมเสีย แต่ก็ถูกตั้ง